Research Article

Structure-based Virtual Screening and Molecular Dynamic Simulation Studies of the Natural Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease

1315 reads

J Ong Chem Res, 2020, 5 (1), 20-31, doi: 10.5281/zenodo.3767102, ISSN 2651-4338

Abstract

In the month of December 2019, the outbreak of COVID-19 disease in China marked the beginning of a global health challenge and the urgent need to discover and design appropriate therapeutic agents. The causative agent, SARS-CoV-2 has a high rate of infectivity and its Main protease enzyme plays a major role in the replication mechanism of the virus. This study is aimed at prospecting for natural compounds that have strong binding affinity and the ability to inhibit the SARS-CoV-2 Main Protease. A library of 1,048 natural compounds (with zero violations for Lipinski and Veber rules) obtained from edible African plants were used for this study. These compounds were molecularly docked against the SARS-CoV-2 Main Protease and the results were screened with the docking score obtained from N3 (-7.8 kcal/mol), which is a co-crystallized ligand of the target protein. Further screening for molar refractivity, pharmacokinetic properties and bioactivity was done with SWISSADME, pKCSM, and Molinspiration webservers respectively. The binding site analyses were done using the PLIP and Fpocket webservers. Molecular dynamic studies and analyses of Apo and Holo structures of target protein were done with the Galaxy webserver. The lead compounds, Rhamnetin and Ellagic acid show better therapeutic prediction than the standard. Whilst Rhamnetin binds at the active site, Ellagic acid binds at another cavity with a probable allosteric effect as suggested by the molecular dynamic studies. Further tests are required to evaluate the SARS-CoV-2 Main protease inhibition properties of the lead compounds.

Keywords: ellagic acid, covid-19, sars-cov-2, main protease, Molecular Dynamic Studies, Rhamnetin

Blockchain Confirmation

Token ID:

Hash:

If you want to upload this article to SciMatic Hybrid Blockchain, install MetaMask extension to your web browser, create a wallet and buy SCI coins at SciMatic using credit or contact your country coordinator.

One article costs 10 SCI coins to be in the Blockchain. Buy SCI Coins

Bibliographic Information

Adekunle Babajide Rowaiye, Olukemi Adejoke Onuh, Rita Maneju Sunday, Zainab Dauda Abdulmalik, Doofan Bur, Nkoli Winifred Emeter, Oluwaseun Adeola Obideyi, Charles Diweni Pelletri, Inikpi Rabi Ujah-Samuel, Chiamaka Rosemary Iwuozor, Priscilla Yahemba Aondona, Victoria Onyayi. Etalong, Nuratu Yussuff, Jude Nnamdi Akpa, (2020). Structure-based Virtual Screening and Molecular Dynamic Simulation Studies of the Natural Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease, Journal of Ongoing Chemical Research, 5(1): 20-31

Bibtex Citation


                        
            @article{adekunle_babajide_rowaiye2020jocr,

                author       = {Adekunle Babajide Rowaiye and Olukemi Adejoke Onuh and Rita Maneju Sunday and Zainab Dauda Abdulmalik and Doofan Bur and Nkoli Winifred Emeter and Oluwaseun Adeola Obideyi and Charles Diweni Pelletri and Inikpi Rabi Ujah-Samuel and Chiamaka Rosemary Iwuozor and Priscilla Yahemba Aondona and Victoria Onyayi. Etalong and Nuratu Yussuff and Jude Nnamdi Akpa},

                title        = {Structure-based Virtual Screening and Molecular Dynamic Simulation Studies of the Natural Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease},

                journal      = {Journal of Ongoing Chemical Research},

                year         = {2020},

                volume       = {5},

                number       = {1},

                pages        = {20-31},

                doi          = {10.5281/zenodo.3767102},

                url          = {https://scimatic.org/show_manuscript/213}

              }

APA Citation

Rowaiye, A.B., Onuh, O.A., Sunday, R.M., Abdulmalik, Z.D., Bur, D., Emeter, N.W., Obideyi, O.A., Pelletri, C.D., Ujah-Samuel, I.R., Iwuozor, C.R., Aondona, P.Y., Etalong, V.O., Yussuff, N., Akpa, J.N., (2020). Structure-based Virtual Screening and Molecular Dynamic Simulation Studies of the Natural Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease. Journal of Ongoing Chemical Research, 5(1), 20-31. https://doi.org/10.5281/zenodo.3767102

Author Information

To change your profile photo, login to scimatic.org, go to your profile and change the photo.
Provide a face photo, and not full body.
It is better to remove the background from your photo. Go to Remove Background and then upload to profile
If you are unable to login, go to Reset My Password provide your email registered with the article and get new password.
In case of any other problem, contact your editor directly or write to us at info @ scimatic.org

Supporting Information

Table 1S: Principal Components Analysis of first three principal components of Apo and Holo structures

	Mpro			Mpro-N3 Complex			Mpro-Ellagc acid Complex			Mpro-Rhamnetin Complex
Residues	PC1	PC2	PC3	PC1	PC2	PC3	PC1	PC2	PC3	PC1	PC2	PC3
1	0.06	0.06	0.08	0.09	0.13	0.07	0.09	0.22	0.33	0.10	0.08	0.20
2	0.05	0.07	0.04	0.10	0.07	0.09	0.06	0.12	0.18	0.07	0.06	0.09
3	0.05	0.06	0.02	0.07	0.03	0.10	0.05	0.09	0.10	0.05	0.06	0.03
4	0.04	0.07	0.03	0.08	0.04	0.08	0.04	0.05	0.06	0.06	0.04	0.03
5	0.03	0.07	0.04	0.09	0.04	0.07	0.04	0.04	0.03	0.07	0.04	0.02
6	0.05	0.07	0.07	0.06	0.06	0.06	0.08	0.03	0.06	0.04	0.04	0.04
7	0.03	0.05	0.06	0.08	0.05	0.04	0.07	0.04	0.04	0.06	0.05	0.04
8	0.03	0.05	0.06	0.09	0.02	0.02	0.07	0.03	0.04	0.05	0.03	0.05
9	0.03	0.05	0.06	0.10	0.02	0.03	0.07	0.03	0.05	0.05	0.03	0.03
10	0.03	0.04	0.05	0.07	0.02	0.04	0.07	0.01	0.05	0.04	0.02	0.05
11	0.03	0.05	0.04	0.06	0.03	0.06	0.05	0.02	0.07	0.03	0.02	0.04
12	0.04	0.06	0.04	0.05	0.02	0.07	0.05	0.01	0.04	0.08	0.01	0.02
13	0.05	0.05	0.04	0.03	0.01	0.05	0.04	0.02	0.03	0.03	0.02	0.03
14	0.02	0.04	0.02	0.04	0.01	0.06	0.04	0.03	0.04	0.04	0.01	0.08
15	0.04	0.04	0.03	0.04	0.02	0.06	0.03	0.02	0.02	0.03	0.05	0.04
16	0.03	0.03	0.03	0.01	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02
17	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.05	0.01	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03
18	0.03	0	0.03	0.03	0.03	0.06	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03
19	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.01	0.04	0.02	0.03	0.05	0.03
20	0.05	0.01	0.04	0.02	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.03	0.02
21	0.07	0.02	0.04	0.04	0.01	0.03	0.04	0.07	0.02	0.04	0.05	0.05
22	0.05	0.02	0.04	0.04	0.03	0.07	0.03	0.07	0.01	0.04	0.05	0.05
23	0.1	0.07	0.05	0.06	0.09	0.07	0.06	0.09	0.08	0.06	0.09	0.09
24	0.11	0.09	0.08	0.06	0.08	0.11	0.08	0.11	0.09	0.06	0.12	0.11
25	0.09	0.04	0.05	0.05	0.03	0.06	0.05	0.09	0.06	0.04	0.08	0.07
26	0.07	0.01	0.05	0.04	0.01	0.02	0.03	0.09	0.06	0.03	0.05	0.04
27	0.05	0	0.05	0.04	0.02	0.02	0.02	0.05	0.03	0.03	0.03	0.06
28	0.03	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04
29	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05
30	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.07	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01
31	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.06	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.02
32	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.06	0.03	0.03	0.01	0.02	0.05	0.04
33	0.06	0.03	0.03	0.02	0.02	0.06	0.03	0.04	0.02	0.04	0.06	0.01
34	0.07	0.03	0.03	0.02	0.02	0.06	0.02	0.04	0.03	0.04	0.08	0.02
35	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.07	0.02	0.04	0.03	0.03	0.06	0.01
36	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.05	0.02	0.05	0.03	0.02	0.04	0.02
37	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.06	0.01	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01
38	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03
39	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.05	0.00	0.02	0.05	0.01	0.01	0.02
40	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.08	0.01	0.04	0.06	0.02	0.02	0.01
41	0.04	0.02	0.05	0.04	0.05	0.08	0.01	0.03	0.06	0.02	0.05	0.02
42	0.04	0.03	0.05	0.04	0.02	0.03	0.01	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03
43	0.03	0.02	0.04	0.05	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.02	0.03
44	0.04	0.04	0.07	0.07	0.05	0.03	0.04	0.01	0.06	0.05	0.04	0.04
45	0.04	0.12	0.08	0.06	0.08	0.02	0.06	0.04	0.04	0.06	0.05	0.06
46	0.07	0.19	0.09	0.07	0.11	0.04	0.06	0.07	0.13	0.08	0.10	0.10
47	0.08	0.18	0.08	0.12	0.07	0.09	0.09	0.11	0.04	0.06	0.09	0.07
48	0.03	0.15	0.07	0.11	0.06	0.11	0.09	0.08	0.06	0.06	0.04	0.05
49	0.06	0.1	0.06	0.06	0.11	0.07	0.05	0.04	0.12	0.08	0.07	0.09
50	0.07	0.12	0.05	0.04	0.13	0.05	0.05	0.05	0.11	0.08	0.12	0.11
51	0.06	0.11	0.07	0.02	0.12	0.06	0.03	0.05	0.11	0.07	0.11	0.10
52	0.06	0.06	0.08	0.02	0.09	0.06	0.04	0.04	0.09	0.07	0.08	0.09
53	0.06	0.06	0.08	0.03	0.07	0.08	0.04	0.04	0.09	0.06	0.08	0.08
54	0.04	0.07	0.06	0.05	0.06	0.08	0.05	0.04	0.07	0.06	0.05	0.05
55	0.04	0.08	0.08	0.07	0.07	0.09	0.07	0.07	0.08	0.07	0.06	0.08
56	0.02	0.06	0.08	0.06	0.13	0.11	0.07	0.05	0.09	0.08	0.08	0.09
57	0.03	0.03	0.07	0.06	0.13	0.10	0.06	0.02	0.05	0.07	0.06	0.08
58	0.02	0.07	0.06	0.08	0.12	0.08	0.06	0.05	0.08	0.08	0.06	0.08
59	0.01	0.11	0.1	0.05	0.10	0.06	0.08	0.06	0.13	0.09	0.07	0.07
60	0.02	0.09	0.1	0.05	0.09	0.06	0.08	0.06	0.10	0.09	0.04	0.02
61	0.02	0.09	0.1	0.06	0.09	0.04	0.11	0.04	0.10	0.09	0.01	0.06
62	0.03	0.09	0.08	0.07	0.05	0.05	0.14	0.07	0.12	0.07	0.05	0.05
63	0.05	0.07	0.06	0.07	0.05	0.06	0.09	0.12	0.07	0.06	0.05	0.02
64	0.06	0.06	0.04	0.07	0.05	0.03	0.04	0.12	0.03	0.06	0.05	0.03
65	0.05	0.06	0.05	0.06	0.02	0.04	0.06	0.08	0.06	0.06	0.04	0.03
66	0.05	0.03	0.04	0.04	0.06	0.03	0.03	0.09	0.03	0.06	0.05	0.01
67	0.08	0.01	0.03	0.04	0.06	0.02	0.02	0.13	0.07	0.06	0.04	0.02
68	0.05	0.02	0.04	0.05	0.02	0.02	0.02	0.05	0.04	0.03	0.05	0.01
69	0.07	0.01	0.05	0.05	0.01	0.05	0.01	0.04	0.05	0.04	0.10	0.03
70	0.07	0.03	0.05	0.05	0.06	0.06	0.01	0.03	0.06	0.03	0.10	0.04
71	0.09	0.04	0.07	0.06	0.05	0.06	0.02	0.03	0.06	0.05	0.10	0.01
72	0.1	0.05	0.07	0.06	0.07	0.06	0.03	0.05	0.09	0.08	0.12	0.01
73	0.1	0.02	0.06	0.07	0.06	0.08	0.03	0.05	0.10	0.05	0.14	0.04
74	0.08	0.02	0.06	0.07	0.05	0.05	0.01	0.05	0.06	0.06	0.11	0.04
75	0.07	0.03	0.03	0.05	0.06	0.07	0.01	0.06	0.04	0.04	0.09	0.04
76	0.07	0.03	0.04	0.06	0.06	0.08	0.02	0.07	0.03	0.05	0.08	0.01
77	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.04	0.03	0.07	0.03	0.05	0.05	0.01
78	0.03	0.06	0.05	0.06	0.04	0.03	0.04	0.09	0.04	0.06	0.06	0.01
79	0.03	0.07	0.05	0.04	0.05	0.03	0.05	0.10	0.04	0.07	0.04	0.01
80	0.04	0.02	0	0.06	0.04	0.03	0.02	0.08	0.05	0.06	0.03	0.02
81	0.03	0.02	0.02	0.05	0.03	0.06	0.02	0.08	0.05	0.06	0.03	0.02
82	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.06	0.04	0.05	0.04	0.05	0.02	0.01
83	0.02	0.05	0.04	0.04	0.04	0.07	0.07	0.09	0.05	0.05	0.04	0.04
84	0.03	0.02	0.02	0.04	0.04	0.06	0.08	0.09	0.07	0.02	0.04	0.04
85	0.02	0.02	0.02	0.04	0.03	0.05	0.04	0.07	0.02	0.02	0.04	0.02
86	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.06	0.03	0.05	0.03	0.02	0.03	0.01
87	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.05	0.02	0.07	0.04	0.02	0.02	0.01
88	0.02	0.02	0.02	0.05	0.01	0.08	0.02	0.07	0.04	0.03	0.03	0.01
89	0.03	0.02	0.01	0.06	0.02	0.08	0.02	0.07	0.03	0.04	0.04	0.01
90	0.04	0.03	0.03	0.03	0.02	0.05	0.03	0.07	0.03	0.05	0.05	0.01
91	0.06	0.04	0.03	0.01	0.02	0.06	0.02	0.06	0.04	0.04	0.07	0.01
92	0.07	0.06	0.07	0.03	0.02	0.07	0.04	0.06	0.04	0.04	0.08	0.02
93	0.09	0.06	0.03	0.05	0.07	0.06	0.03	0.04	0.04	0.01	0.09	0.05
94	0.08	0.05	0.04	0.05	0.07	0.07	0.03	0.03	0.04	0.02	0.09	0.05
95	0.07	0.03	0.02	0.01	0.03	0.07	0.02	0.02	0.03	0.02	0.07	0.01
96	0.1	0.04	0.04	0.05	0.07	0.04	0.03	0.02	0.03	0.03	0.07	0.03
97	0.06	0.05	0.07	0.04	0.09	0.09	0.04	0.02	0.02	0.03	0.05	0.07
98	0.05	0.02	0.04	0.03	0.03	0.07	0.04	0.04	0.01	0.04	0.05	0.04
99	0.05	0.03	0.05	0.03	0.01	0.07	0.03	0.06	0.02	0.06	0.05	0.06
100	0.06	0.02	0.05	0.03	0.01	0.09	0.03	0.07	0.04	0.06	0.04	0.02
101	0.05	0.02	0.06	0.03	0.01	0.08	0.05	0.06	0.04	0.05	0.03	0.04
102	0.06	0.03	0.06	0.04	0.01	0.08	0.06	0.04	0.04	0.05	0.03	0.04
103	0.05	0.02	0.07	0.04	0.01	0.06	0.05	0.04	0.04	0.05	0.03	0.03
104	0.06	0.01	0.07	0.04	0.01	0.06	0.07	0.04	0.03	0.05	0.03	0.04
105	0.05	0.01	0.03	0.05	0.04	0.07	0.02	0.08	0.06	0.04	0.04	0.06
106	0.04	0.01	0.04	0.05	0.04	0.06	0.02	0.09	0.03	0.05	0.04	0.07
107	0.04	0.02	0.03	0.06	0.02	0.06	0.05	0.06	0.03	0.07	0.03	0.05
108	0.04	0.04	0.04	0.08	0.03	0.04	0.06	0.03	0.04	0.07	0.02	0.03
109	0.04	0.04	0.06	0.08	0.05	0.03	0.04	0.04	0.03	0.05	0.02	0.03
110	0.04	0.04	0.05	0.07	0.04	0.02	0.04	0.04	0.02	0.05	0.03	0.03
111	0.04	0.05	0.05	0.07	0.03	0.01	0.04	0.03	0.02	0.05	0.03	0.04
112	0.04	0.03	0.05	0.06	0.03	0.01	0.06	0.03	0.02	0.05	0.03	0.03
113	0.04	0.03	0.05	0.06	0.03	0.02	0.06	0.02	0.02	0.05	0.03	0.02
114	0.03	0.04	0.05	0.06	0.03	0.03	0.04	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02
115	0.02	0.03	0.03	0.06	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03
116	0.01	0.02	0.03	0.06	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.02	0.02
117	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.05	0.02	0.02	0.03	0.03	0.02	0.02
118	0.03	0.01	0.03	0.03	0.05	0.07	0.03	0.03	0.02	0.04	0.04	0.06
119	0.04	0.04	0.03	0.05	0.07	0.11	0.02	0.03	0.02	0.06	0.05	0.14
120	0.04	0.05	0.03	0.03	0.06	0.04	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.02
121	0.03	0.04	0.04	0.03	0.04	0.10	0.02	0.04	0.03	0.05	0.04	0.11
122	0.02	0.06	0.04	0.02	0.02	0.07	0.04	0.04	0.03	0.05	0.03	0.05
123	0.02	0.07	0.05	0.05	0.02	0.05	0.04	0.05	0.05	0.06	0.03	0.02
124	0.02	0.03	0.05	0.07	0.05	0.05	0.06	0.05	0.05	0.04	0.02	0.06
125	0.02	0.05	0.05	0.07	0.04	0.05	0.05	0.03	0.04	0.04	0.03	0.02
126	0.03	0.08	0.04	0.08	0.03	0.02	0.06	0.03	0.03	0.05	0.03	0.02
127	0.03	0.05	0.05	0.08	0.02	0.02	0.06	0.03	0.03	0.05	0.03	0.02
128	0.04	0.04	0.04	0.06	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02	0.06	0.04	0.02
129	0.04	0.04	0.04	0.05	0.03	0.02	0.05	0.02	0.02	0.06	0.04	0.03
130	0.03	0.04	0.04	0.05	0.03	0.03	0.06	0.03	0.02	0.06	0.02	0.02
131	0.03	0.04	0.04	0.05	0.02	0.01	0.06	0.02	0.01	0.07	0.02	0.02
132	0.04	0.04	0.05	0.04	0.04	0.02	0.06	0.04	0.03	0.07	0.01	0.03
133	0.05	0.04	0.06	0.04	0.05	0.03	0.02	0.04	0.03	0.07	0.02	0.02
134	0.05	0.03	0.04	0.03	0.03	0.04	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.01
135	0.05	0.03	0.04	0.03	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.04	0.05
136	0.04	0.03	0.04	0.04	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.04	0.03	0.09
137	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03	0.02	0.05	0.05	0.03	0.06	0.02	0.15
138	0.06	0.07	0.07	0.07	0.08	0.01	0.05	0.04	0.02	0.07	0.06	0.09
139	0.1	0.09	0.04	0.07	0.07	0.02	0.06	0.05	0.07	0.08	0.07	0.06
140	0.08	0.05	0.08	0.09	0.10	0.05	0.05	0.08	0.08	0.07	0.07	0.04
141	0.09	0.07	0.06	0.09	0.12	0.07	0.05	0.12	0.06	0.05	0.08	0.06
142	0.1	0.07	0.04	0.08	0.11	0.08	0.05	0.11	0.13	0.07	0.09	0.07
143	0.07	0.05	0.03	0.07	0.08	0.05	0.03	0.06	0.08	0.06	0.08	0.03
144	0.04	0.01	0.03	0.05	0.08	0.07	0.02	0.04	0.03	0.03	0.07	0.03
145	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.04	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.02
146	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01
147	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.05	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.01
148	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01
149	0.03	0.02	0.05	0.04	0.01	0.03	0.04	0.03	0.02	0.04	0.03	0.02
150	0.03	0.02	0.06	0.06	0.03	0.03	0.05	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02
151	0.04	0.03	0.05	0.07	0.03	0.01	0.06	0.03	0.03	0.05	0.03	0.05
152	0.04	0.03	0.07	0.08	0.02	0.03	0.06	0.05	0.02	0.05	0.04	0.05
153	0.05	0.02	0.09	0.09	0.04	0.05	0.06	0.07	0.02	0.07	0.06	0.05
154	0.05	0.03	0.12	0.08	0.04	0.07	0.07	0.10	0.03	0.07	0.07	0.07
155	0.04	0.05	0.08	0.06	0.02	0.09	0.08	0.09	0.03	0.07	0.06	0.07
156	0.05	0.04	0.07	0.06	0.02	0.04	0.07	0.06	0.03	0.06	0.04	0.08
157	0.04	0.03	0.06	0.05	0.01	0.04	0.05	0.04	0.03	0.04	0.03	0.06
158	0.05	0.02	0.07	0.05	0.01	0.03	0.07	0.03	0.02	0.05	0.03	0.05
159	0.04	0.02	0.04	0.03	0.02	0.04	0.05	0.03	0.02	0.04	0.02	0.03
160	0.04	0.01	0.03	0.02	0.02	0.05	0.05	0.03	0.02	0.04	0.03	0.02
161	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.02
162	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.01
163	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.04	0.02	0.04	0.01
164	0.03	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.03	0.01	0.06	0.02
165	0.03	0.03	0.03	0.01	0.06	0.01	0.03	0.07	0.04	0.03	0.05	0.04
166	0.03	0.03	0.05	0.02	0.08	0.02	0.05	0.08	0.05	0.03	0.05	0.08
167	0.02	0.03	0.05	0.05	0.14	0.07	0.07	0.08	0.13	0.04	0.03	0.12
168	0.03	0.07	0.05	0.07	0.20	0.09	0.10	0.09	0.20	0.05	0.06	0.18
169	0.03	0.05	0.03	0.07	0.22	0.11	0.12	0.11	0.22	0.06	0.03	0.16
170	0.04	0.03	0.02	0.06	0.18	0.10	0.09	0.07	0.15	0.05	0.03	0.18
171	0.03	0.04	0.04	0.05	0.14	0.03	0.05	0.05	0.13	0.04	0.03	0.12
172	0.04	0.03	0.04	0.03	0.07	0.02	0.04	0.04	0.03	0.04	0.02	0.06
173	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.02	0.02	0.04	0.02	0.03	0.03	0.03
174	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.05	0.02
175	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.04	0.02
176	0.04	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.05	0.05	0.03	0.05	0.03
177	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.03	0.05	0.05	0.04	0.02	0.03	0.04
178	0.04	0.04	0.02	0.05	0.03	0.05	0.07	0.04	0.02	0.05	0.06	0.07
179	0.04	0.02	0.03	0.03	0.03	0.04	0.06	0.06	0.09	0.05	0.06	0.02
180	0.04	0.02	0.04	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.02	0.04	0.06	0.04
181	0.04	0.02	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.02	0.04	0.03
182	0.05	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.02	0.06	0.04	0.03	0.04	0.01
183	0.06	0.02	0.04	0.03	0.01	0.03	0.03	0.07	0.03	0.03	0.04	0.02
184	0.04	0.01	0.03	0.04	0.03	0.03	0.06	0.08	0.03	0.03	0.05	0.03
185	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.05	0.09	0.03	0.03	0.05	0.03
186	0.03	0.01	0.02	0.01	0.04	0.06	0.05	0.07	0.03	0.02	0.06	0.02
187	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.06	0.04	0.04	0.02	0.05	0.03
188	0.05	0.06	0.03	0.03	0.10	0.05	0.05	0.04	0.07	0.03	0.08	0.06
189	0.06	0.1	0.04	0.05	0.15	0.03	0.06	0.07	0.08	0.05	0.10	0.08
190	0.07	0.09	0.04	0.07	0.15	0.03	0.05	0.11	0.06	0.04	0.09	0.07
191	0.08	0.12	0.04	0.11	0.16	0.04	0.04	0.13	0.07	0.03	0.09	0.04
192	0.08	0.05	0.02	0.07	0.11	0.05	0.05	0.10	0.06	0.02	0.06	0.02
193	0.14	0.12	0.05	0.05	0.05	0.07	0.04	0.11	0.06	0.05	0.04	0.07
194	0.12	0.04	0.06	0.02	0.02	0.06	0.04	0.09	0.03	0.06	0.04	0.07
195	0.04	0.04	0.06	0.03	0.06	0.05	0.02	0.04	0.08	0.08	0.04	0.06
196	0.08	0.07	0.04	0.05	0.05	0.03	0.05	0.03	0.09	0.07	0.05	0.05
197	0.04	0.07	0.08	0.04	0.05	0.01	0.07	0.02	0.03	0.08	0.07	0.04
198	0.03	0.03	0.09	0.04	0.07	0.02	0.10	0.02	0.04	0.08	0.07	0.06
199	0.03	0.02	0.07	0.03	0.04	0.01	0.08	0.03	0.03	0.06	0.04	0.06
200	0.01	0.01	0.04	0.03	0.03	0.02	0.07	0.02	0.02	0.05	0.01	0.06
201	0.02	0.01	0.04	0.02	0.03	0.02	0.05	0.02	0.02	0.03	0.01	0.04
202	0.02	0.02	0.04	0.03	0.02	0.02	0.05	0.01	0.02	0.04	0.02	0.05
203	0.02	0.02	0.04	0.03	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.03	0.01	0.05
204	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03
205	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03
206	0.03	0.03	0.03	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04
207	0.03	0.03	0.01	0.04	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04
208	0.01	0.03	0.03	0.04	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03
209	0.03	0.02	0.04	0.02	0.00	0.04	0.03	0.02	0.01	0.03	0.03	0.05
210	0.05	0.02	0.02	0.03	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.06
211	0.04	0.02	0.02	0.05	0.03	0.05	0.03	0.00	0.03	0.06	0.04	0.05
212	0.03	0.03	0.03	0.05	0.02	0.04	0.05	0.03	0.03	0.06	0.04	0.04
213	0.06	0.06	0.02	0.04	0.02	0.07	0.06	0.03	0.04	0.06	0.05	0.07
214	0.06	0.05	0.02	0.08	0.03	0.09	0.07	0.03	0.04	0.07	0.06	0.08
215	0.06	0.05	0.04	0.10	0.06	0.06	0.10	0.03	0.05	0.09	0.05	0.05
216	0.04	0.03	0.06	0.10	0.07	0.06	0.08	0.03	0.04	0.09	0.03	0.04
217	0.02	0.04	0.08	0.09	0.07	0.04	0.09	0.05	0.03	0.08	0.03	0.05
218	0.03	0.04	0.11	0.11	0.08	0.04	0.09	0.05	0.04	0.10	0.01	0.04
219	0.03	0.02	0.1	0.09	0.06	0.03	0.05	0.03	0.04	0.08	0.00	0.02
220	0.02	0.02	0.11	0.09	0.05	0.04	0.06	0.03	0.04	0.08	0.02	0.02
221	0.07	0.03	0.11	0.09	0.05	0.05	0.07	0.04	0.04	0.09	0.04	0.03
222	0.09	0.04	0.11	0.12	0.05	0.09	0.09	0.06	0.02	0.11	0.07	0.02
223	0.1	0.04	0.09	0.10	0.01	0.10	0.08	0.04	0.03	0.08	0.09	0.03
224	0.1	0.05	0.08	0.08	0.02	0.08	0.07	0.06	0.04	0.08	0.11	0.07
225	0.1	0.05	0.06	0.08	0.02	0.07	0.06	0.05	0.03	0.06	0.09	0.02
226	0.1	0.05	0.08	0.10	0.04	0.08	0.07	0.04	0.03	0.07	0.10	0.05
227	0.08	0.05	0.08	0.09	0.04	0.11	0.08	0.05	0.01	0.06	0.10	0.05
228	0.1	0.06	0.09	0.07	0.05	0.15	0.08	0.08	0.03	0.07	0.13	0.04
229	0.1	0.07	0.05	0.07	0.04	0.12	0.04	0.07	0.03	0.06	0.11	0.07
230	0.09	0.07	0.05	0.07	0.02	0.08	0.02	0.08	0.01	0.05	0.09	0.06
231	0.08	0.07	0.06	0.08	0.02	0.11	0.08	0.08	0.02	0.05	0.09	0.04
232	0.09	0.06	0.06	0.08	0.05	0.11	0.04	0.06	0.06	0.05	0.11	0.06
233	0.08	0.03	0.05	0.07	0.05	0.09	0.04	0.08	0.08	0.02	0.09	0.05
234	0.07	0.03	0.06	0.07	0.04	0.05	0.06	0.09	0.04	0.03	0.07	0.01
235	0.09	0.04	0.07	0.06	0.04	0.07	0.07	0.06	0.07	0.06	0.09	0.09
236	0.11	0.03	0.07	0.03	0.03	0.08	0.06	0.05	0.08	0.04	0.09	0.10
237	0.08	0.02	0.08	0.01	0.05	0.07	0.06	0.04	0.06	0.04	0.08	0.06
238	0.06	0.02	0.1	0.03	0.05	0.05	0.08	0.07	0.05	0.05	0.05	0.10
239	0.03	0.03	0.08	0.03	0.05	0.03	0.08	0.03	0.04	0.05	0.05	0.05
240	0.02	0.05	0.09	0.06	0.06	0.04	0.09	0.04	0.04	0.07	0.05	0.03
241	0.04	0.06	0.09	0.05	0.08	0.07	0.08	0.04	0.08	0.07	0.07	0.05
242	0.05	0.04	0.07	0.07	0.03	0.07	0.08	0.05	0.04	0.07	0.05	0.03
243	0.05	0.02	0.1	0.08	0.04	0.08	0.09	0.05	0.05	0.09	0.08	0.05
244	0.07	0.03	0.13	0.07	0.04	0.09	0.10	0.05	0.06	0.11	0.09	0.06
245	0.06	0.03	0.14	0.06	0.04	0.09	0.10	0.04	0.06	0.11	0.09	0.07
246	0.06	0.03	0.08	0.06	0.04	0.09	0.08	0.04	0.03	0.09	0.07	0.06
247	0.06	0.03	0.08	0.05	0.04	0.10	0.08	0.05	0.03	0.09	0.07	0.05
248	0.06	0.03	0.1	0.05	0.06	0.11	0.11	0.07	0.03	0.10	0.09	0.04
249	0.06	0.03	0.08	0.04	0.06	0.09	0.10	0.05	0.04	0.07	0.08	0.04
250	0.06	0.03	0.07	0.03	0.05	0.06	0.08	0.04	0.04	0.05	0.06	0.04
251	0.08	0.03	0.1	0.03	0.05	0.07	0.10	0.06	0.01	0.07	0.08	0.04
252	0.08	0.03	0.1	0.02	0.04	0.08	0.10	0.07	0.04	0.08	0.09	0.03
253	0.06	0.02	0.07	0.02	0.02	0.07	0.07	0.03	0.03	0.06	0.06	0.02
254	0.07	0.02	0.07	0.03	0.04	0.04	0.08	0.04	0.01	0.06	0.06	0.05
255	0.1	0.04	0.11	0.04	0.04	0.08	0.11	0.06	0.04	0.07	0.09	0.10
256	0.09	0.04	0.09	0.03	0.04	0.08	0.10	0.05	0.05	0.08	0.09	0.10
257	0.08	0.03	0.08	0.04	0.04	0.06	0.09	0.04	0.01	0.07	0.06	0.08
258	0.09	0.03	0.06	0.05	0.05	0.06	0.11	0.03	0.00	0.07	0.06	0.08
259	0.07	0.02	0.06	0.05	0.04	0.05	0.09	0.03	0.03	0.06	0.04	0.08
260	0.09	0.02	0.05	0.06	0.02	0.05	0.09	0.04	0.04	0.07	0.06	0.07
261	0.07	0.01	0.04	0.05	0.01	0.03	0.06	0.05	0.04	0.06	0.05	0.06
262	0.09	0.02	0.04	0.06	0.01	0.03	0.05	0.04	0.03	0.06	0.06	0.06
263	0.07	0.03	0.04	0.06	0.01	0.03	0.05	0.04	0.03	0.07	0.06	0.08
264	0.05	0.02	0.04	0.03	0.01	0.02	0.04	0.04	0.02	0.05	0.04	0.08
265	0.06	0.01	0.03	0.04	0.02	0.03	0.03	0.05	0.02	0.04	0.04	0.03
266	0.07	0.02	0.05	0.05	0.02	0.04	0.03	0.06	0.03	0.05	0.04	0.05
267	0.06	0.02	0.05	0.03	0.03	0.04	0.03	0.06	0.03	0.06	0.04	0.04
268	0.05	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.01	0.04	0.03	0.03	0.03	0.03
269	0.07	0.03	0.04	0.04	0.06	0.02	0.01	0.05	0.04	0.02	0.04	0.05
270	0.08	0.05	0.05	0.04	0.07	0.04	0.03	0.05	0.06	0.05	0.04	0.05
271	0.05	0.03	0.04	0.03	0.04	0.03	0.04	0.05	0.05	0.05	0.03	0.03
272	0.08	0.05	0.04	0.03	0.02	0.02	0.04	0.06	0.05	0.04	0.05	0.02
273	0.11	0.07	0.05	0.04	0.07	0.01	0.04	0.08	0.05	0.04	0.06	0.05
274	0.12	0.07	0.08	0.04	0.12	0.06	0.05	0.07	0.06	0.07	0.06	0.05
275	0.11	0.04	0.1	0.05	0.11	0.05	0.08	0.07	0.05	0.07	0.05	0.03
276	0.09	0.08	0.12	0.07	0.11	0.04	0.13	0.07	0.04	0.07	0.05	0.04
277	0.13	0.26	0.17	0.13	0.09	0.03	0.26	0.08	0.10	0.12	0.03	0.15
278	0.15	0.05	0.13	0.14	0.18	0.04	0.09	0.12	0.14	0.12	0.04	0.07
279	0.12	0.02	0.11	0.14	0.10	0.05	0.08	0.07	0.08	0.11	0.03	0.03
280	0.07	0.03	0.07	0.12	0.07	0.03	0.05	0.06	0.07	0.10	0.03	0.04
281	0.04	0.01	0.06	0.09	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.08	0.03	0.05
282	0.06	0.02	0.07	0.10	0.04	0.03	0.03	0.05	0.04	0.08	0.04	0.04
283	0.08	0.04	0.1	0.15	0.08	0.04	0.04	0.06	0.07	0.13	0.04	0.04
284	0.06	0.04	0.06	0.12	0.08	0.05	0.03	0.05	0.08	0.11	0.04	0.05
285	0.06	0.07	0.03	0.10	0.08	0.06	0.05	0.08	0.10	0.12	0.03	0.04
286	0.05	0.05	0.05	0.07	0.05	0.04	0.04	0.07	0.05	0.10	0.04	0.05
287	0.04	0.03	0.05	0.04	0.05	0.03	0.03	0.07	0.05	0.07	0.03	0.04
288	0.03	0.02	0.04	0.05	0.02	0.04	0.05	0.04	0.01	0.05	0.04	0.04
289	0.01	0.02	0.04	0.05	0.03	0.02	0.04	0.02	0.02	0.05	0.04	0.04
290	0.03	0.02	0.05	0.06	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.05	0.05	0.02
291	0.04	0.03	0.02	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.04	0.02
292	0.04	0.04	0.03	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.03
293	0.03	0.04	0.05	0.03	0.02	0.04	0.03	0.05	0.02	0.03	0.03	0.05
294	0.04	0.04	0.03	0.04	0.02	0.04	0.03	0.05	0.02	0.05	0.06	0.05
295	0.04	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.03	0.04	0.02	0.04	0.06	0.05
296	0.03	0.05	0.02	0.03	0.01	0.07	0.02	0.04	0.01	0.03	0.06	0.05
297	0.03	0.06	0.04	0.01	0.03	0.07	0.03	0.07	0.01	0.05	0.05	0.04
298	0.02	0.05	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.10	0.01	0.06	0.03	0.03
299	0.02	0.07	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.08	0.04	0.06	0.05	0.05
300	0.02	0.09	0.03	0.05	0.02	0.03	0.04	0.05	0.02	0.05	0.06	0.01
301	0.07	0.07	0.03	0.04	0.03	0.06	0.10	0.05	0.03	0.07	0.04	0.01
302	0.03	0.23	0.06	0.07	0.08	0.08	0.08	0.06	0.05	0.07	0.02	0.04
303	0.04	0.2	0.06	0.04	0.07	0.09	0.08	0.03	0.05	0.03	0.04	0.06
304	0.06	0.2	0.07	0.04	0.05	0.08	0.09	0.03	0.04	0.05	0.05	0.09
305	0.07	0.2	0.05	0.04	0.04	0.09	0.09	0.04	0.03	0.09	0.07	0.09
306	0.14	0.28	0.05	0.11	0.09	0.09	0.09	0.09	0.17	0.14	0.22	0.27

Total (global)	15.37	13.21	15.53	15.54	13.79	15.58	14.99	15.33	13.72	15.94	15.40	14.27
Average (global)	0.05	0.04	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.04	0.05	0.05	0.05

Total (regional)	1.00	0.97	0.81	0.96	1.83	1.02	0.85	1.28	1.45	0.78	1.26	1.13
Average (regional)	0.05	0.05	0.04	0.05	0.09	0.05	0.04	0.06	0.07	0.04	0.06	0.06

Table 2S: Per residue RMSF values for Apo and Holo structures

Residues	Mpro	Mpro-N3	Mpro-Ellagic acid	Mpro-Rhamnetin
1	1.21	1.54	2.36	1.95
2	0.94	1.52	1.54	1.29
3	0.81	0.93	0.93	0.80
4	0.80	0.76	0.78	0.87
5	0.71	0.76	0.60	0.89
6	0.80	0.82	0.85	0.78
7	0.70	0.71	0.75	0.77
8	0.63	0.70	0.71	0.70
9	0.77	0.79	0.77	0.78
10	0.68	0.68	0.75	0.81
11	0.73	0.62	0.73	0.76
12	0.78	0.63	0.65	1.08
13	0.74	0.59	0.62	0.56
14	0.66	0.57	0.64	0.71
15	0.71	0.57	0.73	0.75
16	0.46	0.45	0.45	0.51
17	0.54	0.46	0.39	0.50
18	0.50	0.48	0.39	0.45
19	0.57	0.43	0.43	0.51
20	0.58	0.44	0.46	0.46
21	0.77	0.52	0.75	0.65
22	0.69	0.58	0.64	0.69
23	1.29	0.97	1.19	1.16
24	1.50	1.12	1.35	1.48
25	1.07	0.71	0.98	0.97
26	0.75	0.50	0.79	0.61
27	0.60	0.41	0.46	0.54
28	0.46	0.39	0.36	0.42
29	0.44	0.55	0.39	0.50
30	0.50	0.51	0.37	0.40
31	0.50	0.43	0.36	0.44
32	0.58	0.46	0.46	0.56
33	0.71	0.54	0.61	0.69
34	0.72	0.56	0.56	0.74
35	0.53	0.51	0.50	0.56
36	0.37	0.48	0.47	0.42
37	0.39	0.47	0.46	0.39
38	0.40	0.41	0.36	0.34
39	0.38	0.43	0.45	0.41
40	0.45	0.53	0.59	0.43
41	0.57	0.68	0.58	0.49
42	0.69	0.50	0.56	0.53
43	0.54	0.52	0.55	0.56
44	0.72	0.76	0.75	0.76
45	1.17	0.74	0.84	0.91
46	1.56	1.10	1.09	1.35
47	1.61	1.26	1.31	1.46
48	1.17	1.07	1.16	1.22
49	1.08	1.06	0.58	1.09
50	1.15	1.07	0.89	1.22
51	1.12	0.99	0.90	1.18
52	0.89	0.88	0.79	1.04
53	0.95	0.96	0.88	1.09
54	0.86	0.90	0.76	0.85
55	1.03	1.11	0.96	1.11
56	0.92	1.20	0.98	1.22
57	0.78	1.05	0.84	1.05
58	0.87	1.09	0.89	1.01
59	1.14	1.09	1.16	1.20
60	1.02	0.99	1.26	1.24
61	1.00	0.83	1.15	1.17
62	1.01	0.89	1.46	1.03
63	0.88	0.82	1.15	0.85
64	0.93	0.82	0.93	0.97
65	0.83	0.71	0.91	0.95
66	0.65	0.66	0.68	0.79
67	0.88	0.74	0.84	0.81
68	0.64	0.54	0.51	0.56
69	0.80	0.66	0.71	0.84
70	0.86	0.80	0.88	0.83
71	1.10	1.07	1.23	1.09
72	1.53	1.15	1.41	1.35
73	1.27	0.96	1.19	1.21
74	0.98	0.78	0.82	0.97
75	0.82	0.75	0.64	0.80
76	0.82	0.82	0.70	0.85
77	0.62	0.63	0.64	0.68
78	0.69	0.62	0.79	0.78
79	0.73	0.60	0.87	0.78
80	0.60	0.61	0.72	0.82
81	0.61	0.56	0.69	0.78
82	0.53	0.56	0.64	0.63
83	0.59	0.62	0.88	0.69
84	0.53	0.64	0.97	0.61
85	0.46	0.50	0.63	0.54
86	0.39	0.45	0.54	0.48
87	0.44	0.48	0.58	0.43
88	0.48	0.60	0.59	0.51
89	0.42	0.68	0.52	0.56
90	0.55	0.48	0.58	0.62
91	0.70	0.52	0.58	0.67
92	0.88	0.61	0.74	0.82
93	0.97	0.83	0.72	0.88
94	0.97	0.79	0.75	0.85
95	0.78	0.57	0.56	0.62
96	1.13	0.94	0.83	0.87
97	0.94	0.96	0.63	0.80
98	0.68	0.61	0.61	0.69
99	0.69	0.56	0.67	0.86
100	0.72	0.55	0.72	0.85
101	0.71	0.50	0.71	0.72
102	0.76	0.55	0.78	0.71
103	0.71	0.55	0.68	0.73
104	0.75	0.56	0.72	0.76
105	0.69	0.69	0.71	0.74
106	0.67	0.62	0.81	0.78
107	0.68	0.63	0.72	0.89
108	0.73	0.65	0.69	0.82
109	0.74	0.67	0.55	0.74
110	0.60	0.57	0.50	0.62
111	0.65	0.52	0.45	0.72
112	0.56	0.52	0.54	0.61
113	0.52	0.50	0.57	0.58
114	0.58	0.54	0.53	0.54
115	0.54	0.54	0.47	0.49
116	0.62	0.58	0.55	0.55
117	0.53	0.49	0.55	0.53
118	0.62	0.66	0.50	0.66
119	0.85	1.02	0.56	1.00
120	0.82	0.67	0.51	0.62
121	0.87	0.78	0.56	0.90
122	0.77	0.55	0.66	0.76
123	0.79	0.51	0.75	0.87
124	0.63	0.86	0.85	0.87
125	0.60	0.58	0.63	0.60
126	0.70	0.59	0.63	0.65
127	0.62	0.62	0.60	0.65
128	0.60	0.57	0.51	0.67
129	0.71	0.50	0.59	0.67
130	0.58	0.48	0.62	0.67
131	0.54	0.44	0.57	0.71
132	0.64	0.59	0.68	0.73
133	0.69	0.57	0.49	0.72
134	0.59	0.52	0.43	0.54
135	0.61	0.46	0.52	0.57
136	0.61	0.43	0.53	0.66
137	0.65	0.64	0.69	0.99
138	1.08	0.90	0.77	1.04
139	1.44	0.88	0.88	1.02
140	1.15	0.99	0.91	0.95
141	1.23	1.17	1.05	1.01
142	1.30	1.10	1.17	1.12
143	0.99	0.85	0.80	1.07
144	0.66	0.70	0.51	0.81
145	0.57	0.45	0.47	0.55
146	0.46	0.43	0.42	0.44
147	0.43	0.45	0.48	0.47
148	0.42	0.43	0.44	0.51
149	0.54	0.45	0.50	0.49
150	0.55	0.53	0.53	0.52
151	0.62	0.55	0.65	0.63
152	0.68	0.60	0.67	0.71
153	0.95	0.81	0.86	1.02
154	1.13	0.89	1.00	1.17
155	0.92	0.83	0.95	1.07
156	0.75	0.62	0.76	0.82
157	0.63	0.50	0.60	0.64
158	0.66	0.51	0.65	0.61
159	0.52	0.46	0.56	0.54
160	0.54	0.55	0.57	0.59
161	0.46	0.48	0.49	0.51
162	0.43	0.46	0.44	0.49
163	0.43	0.37	0.48	0.49
164	0.46	0.40	0.43	0.48
165	0.50	0.50	0.61	0.65
166	0.65	0.65	0.77	0.67
167	0.85	1.04	1.13	0.79
168	1.42	1.49	1.78	1.13
169	1.20	1.54	1.93	1.06
170	1.22	1.34	1.39	1.06
171	0.69	1.02	1.00	0.83
172	0.62	0.59	0.62	0.59
173	0.52	0.49	0.47	0.53
174	0.47	0.39	0.42	0.50
175	0.42	0.31	0.44	0.47
176	0.53	0.55	0.72	0.56
177	0.55	0.60	0.79	0.61
178	0.60	0.67	0.86	0.84
179	0.55	0.50	0.93	0.79
180	0.60	0.44	0.61	0.73
181	0.49	0.37	0.48	0.51
182	0.56	0.38	0.52	0.49
183	0.62	0.47	0.59	0.59
184	0.67	0.65	0.76	0.71
185	0.60	0.55	0.69	0.66
186	0.56	0.57	0.67	0.74
187	0.60	0.55	0.69	0.61
188	0.79	0.86	0.76	0.74
189	1.04	1.11	0.95	0.99
190	1.09	1.08	1.06	0.97
191	1.31	1.37	1.05	0.97
192	0.98	0.98	0.82	0.78
193	1.67	0.99	0.95	0.97
194	1.56	0.90	0.88	0.97
195	0.88	0.90	0.95	1.08
196	1.06	0.97	1.00	1.01
197	0.90	0.65	0.80	0.97
198	0.68	0.64	0.97	0.98
199	0.53	0.50	0.73	0.74
200	0.48	0.43	0.61	0.63
201	0.46	0.34	0.50	0.47
202	0.47	0.36	0.49	0.53
203	0.43	0.32	0.46	0.44
204	0.37	0.30	0.38	0.38
205	0.40	0.29	0.33	0.33
206	0.50	0.32	0.44	0.36
207	0.45	0.37	0.38	0.39
208	0.40	0.33	0.36	0.43
209	0.49	0.32	0.38	0.49
210	0.55	0.43	0.39	0.53
211	0.49	0.46	0.47	0.69
212	0.49	0.45	0.59	0.73
213	0.78	0.55	0.65	0.76
214	0.81	0.74	0.68	0.89
215	0.85	0.83	0.90	1.00
216	0.69	0.80	0.75	0.90
217	0.67	0.78	0.82	0.94
218	0.81	0.83	0.81	1.09
219	0.71	0.73	0.59	0.85
220	0.69	0.73	0.64	0.87
221	0.88	0.80	0.71	1.02
222	1.10	1.07	0.99	1.25
223	1.11	0.89	0.83	1.11
224	1.10	0.71	0.83	1.12
225	1.10	0.69	0.67	0.92
226	1.16	0.86	0.75	0.98
227	1.03	0.92	0.83	0.94
228	1.21	0.96	0.99	1.12
229	1.18	0.90	0.79	1.06
230	1.00	0.68	0.64	0.81
231	1.03	0.77	0.91	0.87
232	1.13	0.93	0.78	0.98
233	0.97	0.78	0.85	0.77
234	0.85	0.67	0.92	0.65
235	1.06	0.83	0.96	0.95
236	1.20	0.75	0.88	0.96
237	0.93	0.74	0.87	0.87
238	0.86	0.88	1.00	1.00
239	0.61	0.66	0.73	0.73
240	0.78	0.76	0.85	0.83
241	0.92	0.84	0.91	0.92
242	0.81	0.67	0.78	0.78
243	0.80	0.79	0.98	1.03
244	0.96	0.79	1.04	1.22
245	1.02	0.72	1.07	1.22
246	0.83	0.70	0.85	1.00
247	0.85	0.72	0.87	1.04
248	0.90	0.80	1.11	1.17
249	0.84	0.64	1.00	0.93
250	0.74	0.54	0.82	0.73
251	1.02	0.63	1.03	0.99
252	1.02	0.56	1.07	1.05
253	0.72	0.46	0.75	0.76
254	0.77	0.51	0.78	0.85
255	1.14	0.64	1.10	1.14
256	1.11	0.64	1.03	1.12
257	0.94	0.68	0.86	0.96
258	1.01	0.67	1.01	0.92
259	0.81	0.60	0.86	0.84
260	0.86	0.64	0.84	0.90
261	0.76	0.58	0.68	0.79
262	0.86	0.61	0.63	0.82
263	0.81	0.55	0.61	0.89
264	0.69	0.45	0.51	0.75
265	0.70	0.46	0.49	0.61
266	0.78	0.50	0.57	0.71
267	0.73	0.47	0.55	0.75
268	0.64	0.39	0.43	0.55
269	0.75	0.56	0.47	0.61
270	0.89	0.70	0.58	0.78
271	0.67	0.62	0.63	0.76
272	0.96	0.56	0.71	0.80
273	1.20	0.73	0.77	0.90
274	1.35	1.15	1.13	1.16
275	1.20	1.10	1.18	1.04
276	1.20	1.12	1.31	1.04
277	2.45	1.50	2.27	1.60
278	1.91	1.63	1.59	1.57
279	1.32	1.14	1.17	1.27
280	0.86	0.95	0.96	1.09
281	0.59	0.73	0.67	0.87
282	0.78	0.84	0.79	0.93
283	1.02	1.16	1.03	1.35
284	0.75	1.04	0.91	1.19
285	0.95	1.03	1.09	1.25
286	0.80	0.73	0.85	1.04
287	0.63	0.60	0.70	0.84
288	0.54	0.50	0.57	0.63
289	0.45	0.45	0.53	0.59
290	0.56	0.51	0.52	0.65
291	0.52	0.44	0.43	0.60
292	0.55	0.40	0.43	0.58
293	0.59	0.38	0.54	0.55
294	0.56	0.51	0.55	0.72
295	0.58	0.44	0.45	0.65
296	0.62	0.47	0.49	0.61
297	0.76	0.52	0.62	0.80
298	0.75	0.47	0.69	0.74
299	0.80	0.52	0.77	0.77
300	0.86	0.67	0.74	0.78
301	1.26	0.82	1.12	1.00
302	1.71	1.00	1.31	1.24
303	1.51	0.90	1.07	1.05
304	1.69	0.89	1.00	1.19
305	1.66	0.83	1.06	1.47
306	3.00	1.66	1.58	2.70

Total Global	246.83	212.67	232.45	249.35
Av Global	0.81	0.70	0.76	0.81

Total Regional	17.21	16.93	16.34	16.24
Av regional	0.86	0.85	0.82	0.81

Structure-based Virtual Screening and Molecular Dynamic Simulation Studies of the Natural Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease

Abstract

Blockchain Confirmation

Bibliographic Information

Author Information

Supporting Information

About

Services

Legal

License

Structure-based Virtual Screening and Molecular Dynamic Simulation Studies of the Natural Inhibitors of SARS-CoV-2 Main Protease

Abstract

Share This Paper

Blockchain Confirmation

Bibliographic Information

Author Information

Supporting Information

About

Services

Legal

License