İçme sularının dezenfekte edilmesinin amacı, su ile geçen hastalıklara sebep olan patojen mikroorganizmaları öldürmektir. Kişisel tüketim için, az miktardaki içme suyu, bakteri filtrelerinden süzülerek veya kaynatılarak (10-20 dak.) dezenfekte edilebilir. İçme suları genel olarak, klor ve kloraminler (0.1-1.0 mg/l), ozon (0.1-0.5 mg/l), klor dioksit (0.3-0.5 mg/l), iyot (0.5-1.0 mg/l), brom (0.2-0.3 mg/l), ferratlar (1.2-6.0 mg/l), yüksek pH şartları (10.0-12.5), hidrojen peroksit (30-90 mg/l), iyonize radyasyon (24.000-420.000 rad), potasyum permanganat (1.0-16.0 mg/l), gümüş ve bileşikleri (0.02-0.06 mg/l) ve ultra-viyole (UV) ışınları (240-280 nm, 160-1300 µW, san/cm2) uygulanarak dezenfekte edilmektedir. Mikroorganizmalara etkisi, maliyeti ve uygulama kolaylığı bakımından, içme suyu dezenfeksiyonu için en uygun dezenfektan maddeler, klor, ozon ve klor dioksittir.