A garoupa-verdadeira (Epinephelus marginatus) é uma espécie de serranídeo com grande importância ecológica e boas perspectivas para o cultivo. A investigação da morfologia do trato digestório, associada à atividade alimentar, é fundamental para a compreensão da biologia dessa espécie e premissa básica para pesquisas sobrerequerimentos nutricionais, desenvolvimento de rações e práticas adequadas de manejo alimentar. O presente trabalho descreve a anatomia e, por meio da microscopia de luz, as variações histológicas ao longo do tubo digestório de juvenis de Epinephelus marginatus, correlacionando a histologia de cada seguimento com as respectivas funções e o hábito alimentar. Verificou-se que essa espécie possui elevado número de tipos celulares ao longo do tubo digestório que estão intimamente relacionados com a resposta imunológica inata e adaptativa, permitindo o hábito alimentar detritívoro.