La crisis financiera internacional ha actuado como catalizador de un profundo proceso de cambio en la supervisión financiera y en su modelo de negocio. Este trabajo pretende analizar los recientes procesos de reorganización bancaria iniciados en las entidades de ámbito territorial (cajas de ahorros y cooperativas de crédito) que, a su vez, son identificadas como entidades financieras de economía social. Su especial arraigo territorial ha llevado a la posibilidad de aplicación de una innovadora fórmula legal propuesta por la Unión Europea denominada Sistema Institucional de Protección (SIP), surgida meses antes del estallido de la crisis financiera internacional. Con este propósito, se contempla, primeramente, el entorno configurado por las consecuencias de la crisis en el sector, para, a continuación, presentar los SIP realizados o iniciados hasta la fecha, haciendo especial referencia al sector del crédito cooperativo europeo, con un análisis econométrico centrado en España. Este análisis pretende determinar en qué medida los factores de mayor influencia en la constitución de un SIP están relacionados con la homogeneidad en el modelo de negocio. Del análisis realizado se ha podido demostrar que los criterios de homogeneidad en variables relacionadas con el modelo de negocio pesan más en las cooperativas de crédito que en las cajas de ahorros