Biyolüminesans yöntemi ile herhangi bir örnekteki mikroorganizma sayısının tahminlenmesi ateş böceklerinde görülen lusiferin-lusiferaz reaksiyonuna bağlı hızlı ve duyarlı bir tekniktir. ATP biyolüminesans yönteminde en fazla 1 saat içinde sonuç alınabilmektedir. Ancak bu yöntemde bazen gıda orijinli somatik ATP, mikrobiyal ATP’nin saptanmasında bazı interferanslara neden olmakta ve sağlıklı sonuçlar elde edilememektedir. Bu yöntemle spesifik bir takım mikroorganizmaların ve patojenlerin analizinin de yapılabilmesi için şu anda mevcut çalışmaların dışında değişik çalışmalar yapılmalıdır.